CRAN Package Check Results for Package stacks

Last updated on 2021-09-21 02:49:26 CEST.

Flavor Version Tinstall Tcheck Ttotal Status Flags
r-devel-linux-x86_64-debian-clang 0.2.1 15.04 567.65 582.69 OK
r-devel-linux-x86_64-debian-gcc 0.2.1 14.20 414.60 428.80 OK
r-devel-linux-x86_64-fedora-clang 0.2.1 765.50 NOTE
r-devel-linux-x86_64-fedora-gcc 0.2.1 683.84 NOTE
r-devel-windows-x86_64 0.2.1 19.00 533.00 552.00 OK
r-devel-windows-x86_64-gcc10-UCRT 0.2.1 ERROR
r-patched-linux-x86_64 0.2.1 13.20 538.22 551.42 OK
r-patched-solaris-x86 0.2.1 237.90 ERROR
r-release-linux-x86_64 0.2.1 13.23 542.11 555.34 OK
r-release-macos-arm64 0.2.1 NOTE
r-release-macos-x86_64 0.2.1 NOTE
r-release-windows-ix86+x86_64 0.2.1 32.00 501.00 533.00 OK
r-oldrel-macos-x86_64 0.2.1 NOTE
r-oldrel-windows-ix86+x86_64 0.2.1 32.00 527.00 559.00 OK

Check Details

Version: 0.2.1
Check: dependencies in R code
Result: NOTE
    Namespaces in Imports field not imported from:
     ‘workflowsets’ ‘yardstick’
     All declared Imports should be used.
Flavors: r-devel-linux-x86_64-fedora-clang, r-devel-linux-x86_64-fedora-gcc, r-devel-windows-x86_64-gcc10-UCRT, r-patched-solaris-x86, r-release-macos-arm64, r-release-macos-x86_64, r-oldrel-macos-x86_64

Version: 0.2.1
Check: Rd cross-references
Result: NOTE
    Undeclared packages ‘h2o’, ‘SuperLearner’ in Rd xrefs
Flavor: r-devel-linux-x86_64-fedora-clang

Version: 0.2.1
Check: whether package can be installed
Result: WARN
    Found the following significant warnings:
     WARNING: installation-time patches will not be applied, could not get the patches index
Flavor: r-devel-windows-x86_64-gcc10-UCRT

Version: 0.2.1
Check: PDF version of manual
Result: WARN
    LaTeX errors when creating PDF version.
    This typically indicates Rd problems.
Flavor: r-devel-windows-x86_64-gcc10-UCRT

Version: 0.2.1
Check: PDF version of manual without hyperrefs or index
Result: ERROR
    Re-running with no redirection of stdout/stderr.
Flavor: r-devel-windows-x86_64-gcc10-UCRT

Version: 0.2.1
Check: installed package size
Result: NOTE
     installed size is 5.0Mb
     sub-directories of 1Mb or more:
     data 1.6Mb
     doc 1.7Mb
     help 1.5Mb
Flavor: r-patched-solaris-x86

Version: 0.2.1
Check: tests
Result: ERROR
     Running ‘testthat.R’ [55s/67s]
    Running the tests in ‘tests/testthat.R’ failed.
    Complete output:
     > library(testthat)
     > library(stacks)
     >
     > test_check("stacks")
     ══ Skipped tests ═══════════════════════════════════════════════════════════════════════════════════════════════════════════════════════════════════════════════════════════════════════════════════════════════════════════════════════════════════════════════════════════════════════════════════════════════════════════════════════════════════════════════════════════════════════════════════════════════════════════════════════════════════════════════════════════════════════════════════════════════════════════════════════════════════════════════════════════════════════════════════════════════════════════════════════════════════════════════════════════════════════════════════════════════════════════════════════════════════════════════════════════════════════════════════════════════════════════════════════════════════════════════════════════════════════════════════════════════════════════════════════════════════════════════════════════════════════════════════════════════════════════════════════
     • On CRAN (35)
     • still some inconsistencies with stored objects (3)
    
     ══ Failed tests ════════════════════════════════════════════════════════════════════════════════════════════════════════════════════════════════════════════════════════════════════════════════════════════════════════════════════════════════════════════════════════════════════════════════════════════════════════════════════════════════════════════════════════════════════════════════════════════════════════════════════════════════════════════════════════════════════════════════════════════════════════════════════════════════════════════════════════════════════════════════════════════════════════════════════════════════════════════════════════════════════════════════════════════════════════════════════════════════════════════════════════════════════════════════════════════════════════════════════════════════════════════════════════════════════════════════════════════════════════════════════════════════════════════════════════════════════════════════════════════════════════════════════════
     ── Error (test_cran.R:45:3): basic stacks pipeline works ───────────────────────
     Error: Problem with `mutate()` column `members`.
     ℹ `members = purrr::map(data, ~num_members(.x, pens))`.
     ✖ need at least two non-NA values to interpolate
     Backtrace:
     █
     1. ├─`%>%`(...) test_cran.R:45:2
     2. ├─stacks::fit_members(.)
     3. │ └─stacks:::check_model_stack(model_stack)
     4. ├─stacks::blend_predictions(.)
     5. │ ├─base::structure(...)
     6. │ └─stacks:::glmnet_metrics(candidates)
     7. │ └─`%>%`(...)
     8. ├─dplyr::full_join(...)
     9. ├─dplyr::summarize(...)
     10. ├─dplyr::group_by(., penalty, mixture)
     11. ├─tidyr::unnest(., cols = members)
     12. ├─dplyr::select(., mixture, members)
     13. ├─dplyr::mutate(...)
     14. ├─dplyr:::mutate.data.frame(...)
     15. │ └─dplyr:::mutate_cols(.data, ..., caller_env = caller_env())
     16. │ ├─base::withCallingHandlers(...)
     17. │ └─mask$eval_all_mutate(quo)
     18. ├─purrr::map(data, ~num_members(.x, pens))
     19. │ └─stacks:::.f(.x[[i]], ...)
     20. │ └─stacks:::num_members(.x, pens)
     21. │ ├─stats::coef(x, s = penalties)
     22. │ └─glmnet::coef.glmnet(x, s = penalties)
     23. │ ├─stats::predict(...)
     24. │ ├─glmnet:::predict.elnet(...)
     25. │ ├─base::NextMethod("predict")
     26. │ └─glmnet::predict.glmnet(...)
     27. │ └─glmnet:::lambda.interp(lambda, s)
     28. │ └─stats::approx(lambda, seq(lambda), sfrac)
     29. │ └─base::stop("need at least two non-NA values to interpolate")
     30. └─base::.handleSimpleError(...)
     31. └─dplyr:::h(simpleError(msg, call))
    
     [ FAIL 1 | WARN 0 | SKIP 38 | PASS 5 ]
     Error: Test failures
     Execution halted
Flavor: r-patched-solaris-x86